今天给小朋友数据可视化工具时候,发现国内很多人开发出来数据可视化平台,可以满足许多数据可视化需要。想着干脆整了一个...[作者空间]
串联法 orthofinder 已经生成好单拷贝基因串联的序列,可以直接使用。找到orthofinder 已经生成...[作者空间]
limma差异表达分析 本篇笔记的内容是在R语言中利用limma包进行差异表达分析,主要针对转录组测序得到的基因表...[作者空间]
--关于WGNCA的教程,本次的共有三期教程,我们同时做了三个分析的比较,差异性相对还是比较大的,详情可看WGCN...[作者空间]
本期内容为[跟着NC做基因组数据分析],这是你需要的教程,对你一定有帮助。 前言今天花费找文章,看到一篇关于基因组...[作者空间]
7. 差异分析 将基因计数导入 R/RStudio 工作流程完成后,您现在可以使用基因计数表作为 DESeq2 的...[作者空间]
以A01样本为例: 1_rawdata/A01_R1.fq.gz 1_rawdata/A01_R2.fq.gz ...[作者空间]
RAxML最新的帮助手册下载网址: https://cme.h-its.org/exelixis/resource...[作者空间]
相信学习生信的小伙伴不难发现,在定量的时候大多的文章或者公司的结果都有这几种定量的方式:FPKM(RPKM),TP...[作者空间]
本篇推文用于新手清晰了解并掌握植物RNAseq数据分析流程 一、测序数据的介绍 测序数据主要有两个来源 1、自测的...[作者空间]
RNA-seq中的基因表达量计算和表达差异分析 原文链接:RNA-seq中的基因表达量计算和表达差异分析-生物知识...[作者空间]
RNA-Seq数据组装得到的转录本具有编码蛋白质的能力。预测编码区对于确定转录产物在细胞中的分子作用至关重要!!!...[作者空间]
TransDecoder TransDecoder识别转录本序列中的候选编码区,例如使用 Trinity 从头 R...[作者空间]
本来说这期是要更新LncRNA鉴定思路的,但是看到上一期人气低迷,就暂时晚点在弄了,这次就来跟大家分享一下火山图 ...[作者空间]
如何用MEGA-X构建进化树_生物研究_实用技巧_科研星球 (51xxziyuan.com)[https://ww...[作者空间]
1.非编码RNA简介 非编码RNA是一类被认为不具备编码能力RNA,目前已知的已经有十多种,主要包括了:小RNA(...[作者空间]
之前使用gblocks裁剪比对序列,感觉裁剪的不是很智能,大量可能有用的序列被裁剪掉,所以尝试使用trimal。 ...[作者空间]
rawdata可以是从公司直接获得的测序数据或者是网上下载的数据,网上下载数据的流程参考使用SRA Toolkit...[作者空间]
安装本地blast序列比对软件,我们可以搜索一个查询序列定制数据库,例如想研究一个新测序的基因组,或者感兴趣的一组...[作者空间]
作者:May审稿:童蒙编辑:amethyst 01 什么是全基因组复制 多倍化(polyploidy)或全基因加倍...[作者空间]