![WGCNA分析教程五 | [更新版]](https://img.haomeiwen.com/is18865546/3bbe8376edafdcea.png)
一边学习，一边总结，一边分享！ 往期WGCNA分析教程 WGCNA分析 | 全流程分析代码 | 代码一[https...[作者空间]
今天学习绘制下面这个paper里面的一个图。 从图中，可以看出，图片分成2个部分，左边是进化树，右边是类似气泡图。...[作者空间]
0.起因 最近在群里看到一个图，棒棒糖图的点用饼图代替了。 然后又看到一个文章里，用饼图代替了富集分析的点图，妙啊...[作者空间]
导读 考虑到在转录组比对时，有许多软件可以使用，但很少有介绍它们之间的差别。因此，本文主要介绍 STAR, KAL...[作者空间]
salmon是一款不基于比对而直接对基因进行定量的工具，适用于转录组、宏基因组等分析。其优势是： 定量时考虑到不同...[作者空间]
非模式物种 step1:注释把本物种的蛋白序列用diamond到eggnog数据库比对 拿到eggnog的注释结果...[作者空间]
最近在基迪奥平台上看到了这张KEGG富集信息图，刚好手头有批现成的转录组数据，刚好绘制一下给富集图换换风格~~im...[作者空间]
环境配置 质检 去接头 比对 得到count值 最终会在目标文件夹下面获得两个文件，counts.txt和coun...[作者空间]
首先，需要明确一点: 数据量大小其实就是碱基的个数。那么，数据量大小的计算方法是： 单端测序数据量=reads长度...[作者空间]
WGCNA全称weighted gene co-expression network analysis，即加权基因...[作者空间]
CNCB（China National Center for Bioinformation，国家生物信息中心），对...[作者空间]
仅仅一个函数，就可以完成差异表达基因的GO，GSEA，KEGG 分析与可视化，下面来看一看 01 需要的R包 02...[作者空间]
GO、KEGG富集分析是我们做生信分析较为常用的部分，它可以将基因与功能相联系起来。GO指的是Gene Ontol...[作者空间]
在非模式生物中，我们想要获取相应物种的GO或KEGG注释信息，或者描述信息的渠道很少。数据分布不集中，需要我们花费...[作者空间]
对于数据集合的可视化，韦恩图（venn diagram）是一种方式，一般集合不超过5个的时候，可视化效果还是不错的...[作者空间]
转录因子分析的流程 一、从转录因子数据库下载大麦转录因子CDS序列 PlantTFDB - Plant Trans...[作者空间]
参考文献High-resolution spatiotemporal transcriptome mapping ...[作者空间]
小麦三代转录组融合基因定量 三代转录组的序列普遍比较长，得到的是完整的全长的转录本，在后期处理过程中无需组装，大...[作者空间]
