在做monocle的时候，我们最纠结的地方莫过于确定细胞的起点了。如果是比较明确的分析知道起点，或者有参考文献，结...[作者空间]
1.利用箱线图比较两类样本的某个细胞比例差异 比较直观，但是缺点在于如果单细胞样本个数过少且异质性大，导致很难有统...[作者空间]
水滴石穿，非一日之功 本期内容同时发布于单细胞天地微信公众号。 在进行单细胞分析时，非常重要的一步就是聚类分群，而...[作者空间]
在单细胞数据分析当中，当我们聚类分群完成之后，紧接着就是细胞类型注释，细胞类型的注释就离不开 基因marker ，...[作者空间]
github网址：https://github.com/broadinstitute/infercnv[https...[作者空间]
关于Seurat对象的构建请参考：01.单细胞入门-Seurat对象创建[https://www.jianshu....[作者空间]
更多内容请访问个人公众号---KS科研分享与服务--- 接上节（跟着Cell学单细胞转录组分析(二):单细胞转录组...[作者空间]
你们要的单细胞转录组分析系列它来了！！！这个系列会很长，但是我们相信，从开端到结束，你一定能够上手单细胞转录组的分...[作者空间]
注释用的参考数据库 细胞类型鉴定 思路 代码在cell_marker_annotation.R 1、查看所有mar...[作者空间]
安装 创建文件夹存储结果 用CCA后的数据进行拟时序分析 结果展示[作者空间]
一、设置Seurat对象 使用的示例数据集来自10X Genome 测序的 PBMC。下载链接：https://s...[作者空间]
本公众号最新的单细胞推文目录： 分析 单细胞分析实录(1): 认识Cell Hashing[http://mp.w...[作者空间]
Summary Cancer develops as a result of somatic mutation a...[作者空间]
细胞不只是RNA的盒子，而是中心法则的反应器。随着单细胞技术的成熟，同一细胞不同模态的数据也被同时测量出来。在sc...[作者空间]
inferCNV用与探索肿瘤单细胞RNA-seq数据，分析其中的体细胞大规模染色体拷贝数变化(copy numbe...[作者空间]
引言 转坐酶（Transpose）检测染色质开放性（Accessibility）结合高通量测序（Assay for...[作者空间]
前段时间一直在用cellranger count进行单细胞测序数据的处理，不得不说Cell Ranger作为10X...[作者空间]
日常掰瞎 对于bulk-RNA来说，计算两个样本的相关性可以选取共有基因的表达值直接来计算相关系数，从而得到两...[作者空间]
参考原文https://www.jianshu.com/p/29bccd5178db[https://www.ji...[作者空间]
发了几次总是被锁定，哎，再发一次吧 04 单细胞测序质量控制 https://mp.weixin.qq.com/...[作者空间]
