一、Bismark Genome Preparation（建立索引） 重要参数说明 bismark_genome_...[作者空间]
最好的文档其实还是官方文档。。。http://bioconductor.org/packages/release/...[作者空间]
(IV)Bismark甲基化提取 Bismark附带一个补充的bismark_methylation_extrac...[作者空间]
官方手册（2020 Sep更新）https://github.com/FelixKrueger/Bismark/t...[作者空间]
1、去除冗余的reads 结果： 2、将bam文件转化为sam文件 结果： 3、计算每个胞嘧啶的甲基化值 结果：[作者空间]
1、将参考基因组进行重亚硫酸盐的预处理转换 结果： 2、将数据比对到已经转化了的参考基因组上 一次处理单个样本： ...[作者空间]
质控原则 好的结果需要好的数据。原始下机测序数据(raw data)中，有些reads包含有测序接头序列，这些序列...[作者空间]
（上接Mimiconda的安装与配置） 1、上传和下载数据 创建WGBS文件夹用来存放测序数据和参考基因组序列数据...[作者空间]
DNA甲基化是DNA被添加甲基()修饰影响基因功能或者表达。最常见的甲基化是胞嘧啶产生5-甲基胞嘧啶(5-meth...[作者空间]
前言 衔接上一篇数据比对后的结果，使用R包DSS进行处理。 Input文件准备 我们先来复习一下上一节课得到的数据...[作者空间]
前言 因为组里面出了一批甲基化测序数据，使用的技术为BS-seq，处理的时候顺带记录了学习过程，演示使用数据为官方...[作者空间]
