论文 https://academic.oup.com/bioinformatics/article/35/20/...[作者空间]
最近研究中遇到个问题,就是翻来覆去似乎并没有找到类似IGV那种看read比对的基于图型泛基因组的基因组浏览器emm...[作者空间]
使用Q矩阵作为协变量使用emmax进行GWAS分析 数据准备 1.上个推文中vcf转的tped文件snp_filt...[作者空间]
在自然群体(区别于强人工选择)中,如果我们感兴趣的数量性状表现出与特定的地理环境变量有高度的关联性,随着环境变量的...[作者空间]
基因流(也称基因迁移)是指从一个物种的一个种群向另一个种群引入新的遗传物质,从而改变群体“基因库”的组成。通过基因...[作者空间]
https://martha-labbook.netlify.app/[https://martha-labboo...[作者空间]
基于重测序数据用于对sv进行genotype. githup: https://github.com/Illumi...[作者空间]
此部分所有内容来自法国INRA的A. Legarra授课。 GP的发展历史 marker raw files(不喜...[作者空间]
一、Fst含义 群体间遗传分化指数(Fst):是种群分化和遗传距离的一种衡量方法,分化指数越大,差异越大。Fst居...[作者空间]
一 AMOVA分析 1 将 VCF 转换为 arp 格式,定义population PGDspider软件 2 导...[作者空间]
import rdkit from rdkit import Chem from rdkit.Chem impor...[作者空间]
大家好,本周给大家分享的是12月21日发表在Nature Communications上与欧洲酿酒葡萄的起源相关的...[作者空间]
EMMAX是关联分析速度提升的一个代表性算法, 已广泛应用于棉花、大豆和水稻等的复杂性状关联分析。EMMAX认为,...[作者空间]
基本概念: 基因流(也称基因迁移) 是指从一个物种的一个种群向另一个种群引入新的遗传物质,从而改变群体“基因库”的...[作者空间]
ABBA-BABA test ABBA-BABA 统计(也称为 D 统计)为严格二叉进化历史的偏差提供了一种简单而...[作者空间]
根据中国农大邓学梅老师的动物遗传学课程整理(此部分张浩老师主讲,慕课网)。 1 数量遗传的历史 大致分为三个阶段:...[作者空间]
大家好,今天给大家分享一个软件(LDBlockShow)用来绘制LD单倍型块图。在文献中我们经常看到两类图会用到连...[作者空间]
看论文 Genomic insights into the origin, domestication and d...[作者空间]
file.vcf文件如下所示,包含两个样本、四个变异位点: 现在我想把数字基因型变成字母基因型,比如对于rs1 ,...[作者空间]
3010份亚洲稻群体重测序项目是由中国农业科学院作物科学研究所牵头,联合国际水稻研究所、华大基因等16家单位共同完...[作者空间]