1 CD45.1和CD45.2 1.1概述: CD45是存在于除红细胞和浆细胞之外的造血谱系的所有细胞中的受体连接...[作者空间]
这篇文章是单细胞转录组(scRNAseq)和TCRseq联合分析的一个综述,介绍了目前关于这两种数据联合分析的最新...[作者空间]
一、outs目录概括 以下是10X官方给出的一个典型的vdj运行后的output 目录: 二、web_summar...[作者空间]
10× Genomics提供了完整的数据分析方案,单细胞数据转录组分析类似,VDJ数据也使用CellRanger软...[作者空间]
一、什么是免疫组库 免疫组库(Immune Repertoire,IR)是指在指定时间,某个体循环系统中所有功能的...[作者空间]
昨天老师发给我一篇生信女神Shirley Liu的文章,看了里面的内容之后感觉很兴奋~它可以不做免疫组测序,直接从...[作者空间]
Calculation of repertoire metrics VDJTOOLS的CalcDiversityS...[作者空间]
使用《OncoImmunology》一篇paper中的数据进行实战 数据获取地址:https://www.ncbi...[作者空间]
免疫组库(Immune Repertoire,IR)是指个体在某个特定时间其循环系统中所有多样性的T细胞和B细胞的...[作者空间]
mixcr与vdjtools是基于java平台开发的处理从原始序列到定量克隆型的大量免疫组数据的免疫分析软件,在使...[作者空间]
免疫组库(Immune Repertoire,IR)指的是在特定时间段内,机体内T淋巴细胞和B淋巴细胞多样性的总和...[作者空间]
作者:Resther审稿:童蒙编辑:angelica 1.背景介绍 人体淋巴细胞主要包括T细胞、B细胞。B细胞约占...[作者空间]
很多姐妹给大沃沃留言表示看不懂免疫球蛋白检查里的一些英文符号,完全不知道它们是什么意思,也不知道检查这些的意义和作...[作者空间]
Kmer统计计算 在immunarch包中,要计算 kmer 出现的次数非常容易。我们可以直接使用getKmers...[作者空间]
免疫受体数据库简介 具有关于免疫受体特异性的汇总信息的数据库提供了一种直接的方法来注释您的数据并找到与疾病相关的T...[作者空间]
克隆型追踪 Tracking of clonotypes 克隆型追踪(Clonotype tracking)是一种...[作者空间]
在Immunarch包中,我们可以使用repDiversity函数计算免疫组库的多样性。它提供了多种方法去评估Re...[作者空间]
基因使用计算 immunarch包带有一个基因片段数据表,其中包含了遵循IMGT[http://www.imgt....[作者空间]
免疫组库重叠分析 免疫组库重叠(Repertoire overlap)是度量不同样本之间TCR或BCR库相似性的最...[作者空间]