写在开头:在表观遗传学领域,染色质免疫沉淀(ChIP)是研究蛋白质(转录因子、组蛋白修饰等)与染色质相互作用的传统...[作者空间]
跟着官网[https://yezhengstat.github.io/CUTTag_tutorial/]学习CUT...[作者空间]
这里是佳奥! 到了数据下载这一步,之前我都是在NCBI上直接用浏览器下载,不过有的数据寻找链接比较耗时,这一次开始...[作者空间]
整理ChIP-seq / CUT & Tag 分析时用到的工具。本文只对使用的工具用法进行简单介绍。 Bowtie...[作者空间]
整理ChIP-seq / CUT & Tag 分析时用到的工具。本文只对使用的工具用法进行简单介绍。 deepto...[作者空间]
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1. 环境配置 2. 数据下载 (1)prefetch下载 首先找到要下载的数据(SRR...号)创建projec...[作者空间]
一、deeptools安装 见我写的第一篇文章《Conda 安装软件万能链接》:Conda安装软件万能链接[htt...[作者空间]
一、deeptoolsplotCorrelation详细介绍 官网说明书——deeptools plotCorrl...[作者空间]
全文分析流程学习按照:九月学徒ChIP-seq学习成果展 一、 怎么将SAR文件转为fastq文件? 1. 【方...[作者空间]
from 生信菜鸟团(http://www.bio-info-trainee.com/1815.html) 我们一...[作者空间]
在实战之前,首先对CHIP-seq分析做一些了解,以下是从各个地方copy过来综合起来的,有些散乱,是我认为重要以...[作者空间]
开篇致谢:下面内容的整个框架是跟着生信技能树发布在bilibili上的ChIP-seq视频学习的,链接:https...[作者空间]
在B站上找到一个介绍ChIP-seq的视频:A gentle introduction to ChIP-Seq。 ...[作者空间]
最近在看《超越双螺旋——神奇的表观遗传密码》这本书,初次接触表观遗传领域,感觉像进入了新世界。今天看的内容与组蛋白...[作者空间]
从GEO下载数据 下载地址https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.c...[作者空间]
知识的学习没有一蹴而就,没有捷近,扎实的学习是唯一的捷近。 一篇RNA-seq分析流程的综述,全面而详细!深度好文...[作者空间]
pre: 各位老铁好~这次对IGV的用法进行进一步的学习和实战,这次的学习主要focus在一些使用技巧上面,一起学...[作者空间]
1.常规下载方式:prefetch 对于常规下载sra数据来说,NCBI提供了它自己的一套工具(SRA-T...[作者空间]