由于实验人员、技术、环境、时间点、芯片处理等各种因素原因,得到的芯片表达矩阵是含有非生物学因素差异的。有时候想分析...[作者空间]
视频教程中曾老师说:介绍GSVA的原因之一旨在说明GEO的数据挖掘方法其实还有很多,除了常用的pipeline,我...[作者空间]
「生信技能树」三阴性乳腺癌表达矩阵探索 系列笔记GEO挖掘实战一、初步探索数据 - 简书GEO挖掘实战二、差异分析...[作者空间]
参考文章:【果子学生信】GEO挖掘教程[https://mp.weixin.qq.com/s?__biz=MzIy...[作者空间]
1.简介 俗话说“巧妇有无米之炊”,学习生信分析最重要的就是需要数据,作为刚入门或即将入门的生信小白来说,数据无疑...[作者空间]
文章来源:生信技能树原文:GEO数据挖掘-第五期-肝细胞癌(HCC)-多组分开差异分析疾病背景 肝细胞癌(HCC)...[作者空间]
文章来源:生信技能树原文:GEO数据挖掘-第四期-肝细胞癌(HCC) 疾病背景 肝细胞癌(HCC),起源于肝细胞,...[作者空间]
文章来源:生信技能树原文:GEO数据挖掘-第三期-口腔鳞状细胞癌(OSCC)文章标题 A pplication o...[作者空间]
首先是学习优秀的帖子 最近处理数据发现同一个平台的RNA-seq或者芯片数据,不同的样本之间有时候竟然存在很大的差...[作者空间]
题目来源:https://mp.weixin.qq.com/s/jzDD05M5AuhCkiavkoLiHg 对G...[作者空间]
题目来源:https://mp.weixin.qq.com/s/jzDD05M5AuhCkiavkoLiHg 使用...[作者空间]
安装包 使用内置数据 使用Hierarchical clustering的方法去看一下聚类的情况 校正批次效应,m...[作者空间]
欢迎关注”生信修炼手册”! 在之前的文章中,我们提到利用网络聚类算法可以从复杂的蛋白质网络中挖掘蛋白复合体或者相应...[作者空间]