基于重测序数据用于对sv进行genotype. githup: https://github.com/Illumi...[作者空间]
Assemblytics， 发表在Bioinformaticshttp://www.ncbi.nlm.nih.go...[作者空间]
call 过很多次SNPs了，每次都加上了--hwe选项，一般是--hwe 0.001，意思是移除不符合哈温平衡的...[作者空间]
本文学习费章军老师文章Genome of Solanum pimpinellifolium provides in...[作者空间]
我梳理了GWAS全基因组关联分析的整个流程，并提供了基本的命令，用到的软件包括BWA、samtools、gatk、...[作者空间]
前言 最近在研究低深度WGS数据检测SV变异，测试了很多个软件，一直没有一个准确的结论。周一很巧地发现了这篇文章，...[作者空间]
String【https://string-db.org/】 2019.11.22 拿到有参转录组的数据，gene...[作者空间]
结构变异(structural variants，SV)结构变异类型:通过pair-ends分析鉴定---插入(I...[作者空间]
SnpEff is a variant annotation and effect prediction tool...[作者空间]
原视频6:测序质量的控制首先建立文件夹 这部分包括fastqc和multiqc两个软件查看测序质量，以及使用tri...[作者空间]
刘小泽写于19.5.29原始数据质控永远是好的分析结果的第一步，我们主流都是采用fastqc软件，结果会产生一个h...[作者空间]
首先，使用ALLbio软件下的breakdancer2vcf.py转化breakdancer得到的out文件Git...[作者空间]
可以用网页版做，但有上限2000个基因的限制。所以今天开发一下怎么用R飞一波。 1. 下载STRING数据库中蛋白...[作者空间]
提到寻找物种之间的同源基因，大家一般想到的是OrthoMCL (http://orthomcl.org/ortho...[作者空间]
在进行正式的mapping记录之前，先记录一下bwa与bowtie2在mapping这个环节的情况。 一般对...[作者空间]
二代测序方式分为三种： single read 单端测序 paired-end read...[作者空间]
文章题目 Toward almost closed genomes with GapFiller 发表期刊及年份...[作者空间]
这篇文章源自上周知识星球星友的一个提问。 当时星友感兴趣的地方在于Insertsize可以有什么用，后来知道他（她...[作者空间]
生物或医学中涉及高通量测序的论文，一般会将原始测序数据上传到公开的数据库，上传方式见测序文章数据上传找哪里；并在文...[作者空间]
