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    空间转录组

    • 10X空间转录组利用空间位置的个性化分析小结
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      2021-11-03
    • 10X空间转录组利用空间位置的个性化分析小结今天领导非让写微信稿,其实我是不太想写的,但是呢,官大一级压死人,所以写的微信稿原版分享给大家,原版是不会有广告什...[作者空间]

    • 10X单细胞空间联合分析之十(RCTD)
      0
      2021-11-02
    • 10X单细胞空间联合分析之十(RCTD)hello,上一篇文章中,10X空间转录组数据分析之空间注释(解卷积,STdeconvolve)[https://...[作者空间]

    • 10X空间转录组数据分析之空间注释(解卷积,STdeconvol
      0
      2021-11-02
    • 10X空间转录组数据分析之空间注释(解卷积,STdeconvolhello,大家好,今天我们来分享一个新的空间注释的方法,当然主要思想还是解卷积,关于空间转录组的注释方法,我已经...[作者空间]

    • 10X空间转录组分析之转录组信息 & 空间位置的联合分析(SED
      0
      2021-11-01
    • 10X空间转录组分析之转录组信息 & 空间位置的联合分析(SEDhello,大家好,今天给大家继续分享10X空间转录组的分析,其实之前分享的内容已经多次强调过空间转录组一定要转录...[作者空间]

    • 10X空间转录组数据分析之空间细胞密度
      0
      2021-10-31
    • 10X空间转录组数据分析之空间细胞密度hello,大家好,今天礼拜天,天津雾霾严重,呆在家里学习一下吧。今天给大家分享的是空间转录组的空间细胞密度的分析...[作者空间]

    • 10X单细胞(10X空间转录组)数据分析之细胞过滤那些事
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      2021-05-02
    • 10X单细胞(10X空间转录组)数据分析之细胞过滤那些事hello,大家好,今天已经是五一假期的第二天,本人呢,哪也去不了,只好在家歇着,所以呢,给自己找点事做,本人93...[作者空间]

    • 10X空间转录组和10X单细胞数据联合分析方法汇总
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      2021-02-23
    • 10X空间转录组和10X单细胞数据联合分析方法汇总大家好,新的一年开始了,我们又要投入到紧张的工作中去了,作为一名10X空间和10X单细胞分析的生信人员,也要开始新...[作者空间]

    • 空间转录组细胞类型的spot distance-based an
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      2021-01-25
    • 空间转录组细胞类型的spot distance-based an在我们生物学的世界里,细胞类型无论是交流还是位置都是在不断的变化之中,当形成一个成熟的组织之后,细胞类型的位置才会...[作者空间]

    • 10X空间转录组做细胞通讯的打开方式
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      2021-01-16
    • 10X空间转录组做细胞通讯的打开方式10X空间转录组这项技术出现的时间也有了1年多之久,很多分析的思路也已经有了比较深的认识,但是对于细胞通讯而言,无...[作者空间]

    • 10X空间转录组的轨迹分析
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      2020-12-09
    • 10X空间转录组的轨迹分析我们做过单细胞的童鞋们来说,轨迹分析并不陌生,然而如果将单细胞的轨迹分析结果运用到空间转录组上,就可以帮助我们了解...[作者空间]

    • 空间转录组第九讲:利用SingleR进行细胞类型注释
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      2020-12-07
    • 空间转录组第九讲:利用SingleR进行细胞类型注释前面我们说过空间转录组技术不是真正的单细胞水平,每个spot会捕获5-10个细胞,这样每个spot里实际上可能存在...[作者空间]

    • 10X空间转录组数据推断基因拷贝数畸变(copy number
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      2020-11-27
    • 10X空间转录组数据推断基因拷贝数畸变(copy number 在空间转录组之前,我们可以利用单细胞数据进行推断CNA,用到的软件就是inferCNV,至于inferCNV的原理...[作者空间]

    • 空间转录组第七讲:多样本合并、marker基因分析
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      2020-09-01
    • 空间转录组第七讲:多样本合并、marker基因分析前面介绍了利用Seurat对10x空间转录组数据单个样本进行数据预处理、降维、聚类分析。今天来继续分享怎么整合多个...[作者空间]

    • 空间转录组第六讲:数据预处理、降维、聚类(seurat)
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      2020-08-29
    • 空间转录组第六讲:数据预处理、降维、聚类(seurat)前面我们有介绍了利用10x Space Ranger软件分析空间转录组原始数据得到可用于下游分析的矩阵和镜像文件。...[作者空间]

    • 空间转录组第一讲:10x空间转录组技术介绍
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      2020-08-26
    • 空间转录组第一讲:10x空间转录组技术介绍最近,空间转录组学研究炙手可热。细胞及其在组织样本中的相对位置之间的关系对于理解疾病病理可能至关重要。空间转录组学...[作者空间]

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