论文 A latitudinal gradient of deep-sea invasions for marin...[作者空间]
论文 https://academic.oup.com/bioinformatics/article/35/20/...[作者空间]
背景 基因组测序现在已经成为生物学研究的一个重要手段,基因组的杂合度和重复序列对后续基因组组装有很大的影响。高杂合...[作者空间]
365篇了,刚好凑齐一年之数。。话说我这个IP属地怎么变来变去的。。 HiCUP是一个处理由Hi-C和捕获Hi-C...[作者空间]
全基因组关联分析(Genome-wide association study,GWAS)是应用基因组中数以百万级别...[作者空间]
GO、KEGG富集分析是我们做生信分析较为常用的部分,它可以将基因与功能相联系起来。GO指的是Gene Ontol...[作者空间]
ssGBLUP经过10多年的发展,已经普遍开始应用在动物育种中。 以前的多步法 基因组评估 问题: 表型的测量 B...[作者空间]
找论文的时候偶然发现的这本参考书,个人感觉内容还挺丰富的,在这里推荐给大家 书名是 《Plant Bioinfor...[作者空间]
GWAS分析基本流程及分析思路[https://www.cnblogs.com/chenwenyan/p/1012...[作者空间]
基本概念 连锁不平衡(LD,linkage disequilibrium)是指 不同基因座(loci)的等位基因(...[作者空间]
目前针对GWAS分析有很多软件,比如Plink、 Tassel、Gapit、EMMAX、gemma和GCTA等等,...[作者空间]
此视频来自B站,是非常好和全的的一个GWAS操作的视频,从开始准备软件下载,数据过滤,到最后的候选基因注释。GWA...[作者空间]
随着高通量组学平台的发展,生物医学研究大多采取了多组学技术结合的方法,不同组学来源(如遗传学、蛋白质组学和代谢组学...[作者空间]
使用CNVcaller进行CNV检测 1.下载CNVcaller 2.构建参考基因组数据库作用:将参考基因组按用户...[作者空间]
写在前面 以下内容均来自我在菲沙基因(Frasergen[http://www.frasergen.com/])暑...[作者空间]
Mosdepth是一种用于快速计算全基因组测序覆盖率的命令行工具。它测量BAM或CRAM文件在基因组中每个核苷酸位...[作者空间]
GATK4流程学习之背景知识与前期准备 - 简书[https://www.jianshu.com/p/97e803...[作者空间]
一、简介 Raven是三代raw reads的组装软件。它首先通过 chaining minimizer hits...[作者空间]
NextPolish是武汉未来组开发的一个三代基因组polish工具(另外一个常用软件是Pilon)。NextPo...[作者空间]
一、原理 原文章:The Sequence alignment/map (SAM) format and SAMt...[作者空间]