Introduction GTDB（Genome Taxonomy Database）是一个专注于基因组分类学的数...[作者空间]
纵向微生物组研究可以捕捉微生物组内的时间变化，以获得对微生物系统的机理认识。近日，《Briefings in Bi...[作者空间]
3.4 微生物数据组成分析 早在1897年，皮尔逊就警告说，在器官测量中使用两个绝对测量值的比值，可能会形成“伪相...[作者空间]
方法来源于上面这篇文章，不得不说，这篇文章运用了非常多复杂的方法去阐述关注的科学问题，真不愧是出自Broad in...[作者空间]
最近一周开始学习ATAC数据分析，目前只是尝试了简单分析，新手小白，如果有小失误欢迎留言~ 1.准备环境 创建co...[作者空间]
拆解地址 14 种差异分析方法步骤以及原理初解[https://xbiomeanalysis.github.io/...[作者空间]
微生物数据特点 Sparsity Compositional Overdispersion Sparsity 即使...[作者空间]
1.创建工作目录，在工作目录下存放公司处理完成的 cleandata 数据 2.在 cleandata的目录下添加...[作者空间]
1. 这个工具有在线网页版，当然KEGG注释还有其他很多工具可以选择比如Diamond，KAAS等等 https:...[作者空间]
大家好，本周给大家分享的是一篇2020年6月2日发表在Cell Host and Microbe上使用比较基因组学...[作者空间]
文献信息标题：Mauve: multiple alignment of conserved genomic seq...[作者空间]
16S分析 Qiime2整理的数据库[https://docs.qiime2.org/2020.6/data-re...[作者空间]
宏基因组学 宏基因组学[https://baike.baidu.com/item/%E5%9F%BA%E5%9B%...[作者空间]
参考文章：1.https://www.jianshu.com/p/c72bb359f050[https://www...[作者空间]
3.1人类微生物组数据研究的主题和统计假设 目前的微生物组研究主要有两个主题：(1)描述微生物组特征与生物、遗传、...[作者空间]
目前有两种方式可计算宏基因组基因的丰度，一种是基于比对，比如bwa,bowtie,soapaligner等主流的比...[作者空间]
12年有篇BMC的文献对几款预测的软件做了评估，其实参考大多数的文献中最常见的俩个软件也就是Prodigal和Me...[作者空间]
![复现文章中的基因进化树[MUSCLE+FastTree]](https://img.haomeiwen.com/is19527700/7c625fdd31784730.png)
写在前面 复现文章中的figure是检验自己是否完全掌握工具的使用最重要的方式，下面我以2019年南京大学杨四海老...[作者空间]
