对于miRNA靶基因的预测而言,目前有很多数据库都可以做。这些数据库的区别基本上在于纳入的数据量以及预测的算法不同...[作者空间]
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本文章是网友果子的一篇文章的基础上整理出来的。https://www.iikx.com/news/statisti...[作者空间]
相比于网页工具,使用编程语言处理科研数据的一大优势,在于高度的定制化,以及批量处理数据的快捷性和高效性 目录批量处...[作者空间]
TCGA数据下载方法:gdc-client,Xena和gdcRNAtools 需要下载的数据组学信息(样本):(存...[作者空间]
作者:taoyan链接:https://www.jianshu.com/p/b7274afff14f[https:...[作者空间]
基因表达数据预多种临床数据密切相关,特别是这些数据对患者的预后生存判断非常重要。对于芯片(microarray)的...[作者空间]
今天继续介绍dplyr包中的重要函数mutate,其基本功能为创建新列;mutate中的选项几乎是无穷无尽的,可以...[作者空间]
功能富集分析方法 clusterProfiler 支持多种本体论/通路 (ontology/pathway) 的超...[作者空间]
1. 细胞周期背景介绍 细胞周期(cell cycle)是指细胞从一次分裂完成开始到下一次分裂结束所经历的全过程,...[作者空间]
使用ggplot2作图时,尤其是箱线图时,我们都是直接使用的原始数据,而最终图中呈现出了最大值、最小值、中位数之类...[作者空间]
Base R是R语言最基础的部分,同时又是最容易被忽略的,温故而知新,在数据操作过程中不断挖掘其中的宝藏吧!持续更...[作者空间]
数据准备如果使用在线的Gene sets database,则只需要准备Expression dataset文件(...[作者空间]
介绍:TopHat2和Cufflinks是之前常用来作转录组分析的两个工具,它们能够完成这几个任务: (i) (i...[作者空间]
1 整理表格,使symbol转entrezid,利于后面的富集分析。 2 GO 分析 BP,MF and CC分别...[作者空间]
前言 我是临床专业的硕士,说实话,我和同门×是我们导师近年来第一届招收的学硕。最开始的一年没有师兄带确实比较迷茫,...[作者空间]
画热图中耽误时间较久的部分 一. 循环产生的数据框合并 https://www.jianshu.com/p/db5...[作者空间]