hello,大家好,今天我们来分享一个做细胞通讯的分析软件NicheNet,这个软件最大特点就是预测配体活性,所以...[作者空间]
介绍这个包之前,先要搞清楚这个包能干啥。(部分内容摘抄自学术咖) Q1:WGCNA能干嘛?A1:能够将表达模式相似...[作者空间]
寻找差异表达的基因并识别它们的功能,是我们进行RNA测序的最主要目的。很明显,这些差异的基因必然与功能改变密切相关...[作者空间]
这是一篇2018年发表在NBT上的文章,讲述的是两套单细胞数据如何去除批次效应 文章链接: 前言 由于不同的实验室...[作者空间]
原创:黄小仙 小提琴图之前已经画过了,不过最近小仙又看到一种貌美的画法,决定复刻一下。文献中看到的图如下: Ste...[作者空间]
科研猫 部分内容节选自:临床研究与医学统计 对于医生来说,如果有某种“特定功能”来预测患者是否会有未知结果,那么许...[作者空间]
什么是火山图? 火山图其实是一种很形象的叫法,它可以通过关注对象的落点从而直观地展示该对象的所属区域。其通常用于展...[作者空间]
「生信技能树」三阴性乳腺癌表达矩阵探索 系列笔记GEO挖掘实战一、初步探索数据 - 简书GEO挖掘实战二、差异分析...[作者空间]
主题:提出 Ribo-seq 技术的论文链接:Genome-Wide Analysis in Vivo of Tr...[作者空间]
适用场景 当样本为时间节点样本时(如上图,分别为0h,0.5h,3h,6h,12h五个时间节点样本的基因表达量),...[作者空间]
适用场景 富集性分析是各组学进行数据分析的必备分析项,其中,尤以GO和KEGG富集因子图最为常见,见例图。这张图非...[作者空间]
genecards数据库是一个汇总了150个网络数据库的基因功能查询数据库。通过这个数据库我们不仅可以查询到一个基...[作者空间]
论文发表之前我们常常会有递交测序数据到NCBI的需求,这些数据例如:基因组,转录组,ChIP-seq,ATAC-s...[作者空间]
题目 ACE2 correlated with immune infiltration serves as a p...[作者空间]
0.缘起 很多文章中用到GEPIA这个网页工具来进行TCGA和GTEx表达量的联合比较,但在此之前我不知道要怎样在...[作者空间]
DCA曲线简介 DCA是一种评估临床预测模型、诊断试验和分子标记物的简单方法。传统的诊断试验指标如:敏感性,特异性...[作者空间]
WGCNA基本概念 加权基因共表达网络分析(WGCNA)是一种系统生物学方法,用于样品中基因之间的相关模式。WGC...[作者空间]
森林图简介 森林图(forest plot),从定义上讲,它一般是在平面直角坐标系中,以一条垂直于X轴的无效线(通...[作者空间]
01—研究背景 记得在两年前刚学生信时,和很多小伙伴一样,在做完差异基因分析或者进行基因特异性筛选时,发现结果有几...[作者空间]
任务 利用K-均值聚类算法对未标注数据分组 对聚类得到的簇进行后处理 二分K-均值聚类算法 思想 聚类算法几乎可以...[作者空间]