conda create -n rna_seq 安装软件
经过质控后，采用STAR进行比对
虽然做的是无参转录组，但是别人提供的同一物种的reference genome组装质量还可以，所以考虑Trinity genome guide的组装方式，同时也做了de novo assemble进行了比较。
查找Trinity.fasta的ORF，因为Trinity的输出不都是以ORF开始。
eggnog对ORF预测结果进行同源注释
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虽然做的是无参转录组，但是别人提供的同一物种的reference genome组装质量还可以，所以考虑Trinity genome guide的组装方式，同时也做了de novo assemble进行了比较。
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转录组学习一（软件安装） 转录组学习二（数据下载） 转录组学习三（数据质控） 转录组学习四（参考基因组及gt...
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学习资料：B站视频：生物技能树 第八季转录组测序数据分析 一、转录组比对常用软件 转录组比对常用：hisat2、s...
本文标题：转录组学习
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