美文网首页
20201118-融合基因

20201118-融合基因

作者: 野山羊骑士 | 来源:发表于2020-11-18 13:35 被阅读0次

关于基本概念的理解:
https://www.cnblogs.com/aipufu/p/11615336.html
https://www.biomart.cn/experiment/793/2714649.htm
https://www.cnblogs.com/nkwy2012/p/6517753.html

最大收获:

【基于全基因组测序和转录组测序鉴定基因融合】

基因融合的鉴定,可以基于全基因组测序数据(whole-genome sequencing,WGS),也可以利用转录组测序数据(RNA-seq),或者二种技术结合起来更好。

全基因组测序鉴定出的基因融合,基本能确定是由于基因组层面发生某种变异而引起的,但如果没有转录组测序数据,就无法准确判断融合后产生的新基因是否能够表达,或表达量的高低。

而转录组测序数据鉴定出的基因融合,可以明确是能表达的基因融合,但却无法完全确定是否是由基因组变异产生的,还是来源于两个不同基因转录后发生的RNA融合。

因此,如果条件允许,同时结合全基因组测序和转录组测序来鉴定基因融合,能够获得更准确的鉴定结果。

相关文章

  • 20201118-融合基因

    关于基本概念的理解:https://www.cnblogs.com/aipufu/p/11615336.html[...

  • 融合基因功能预测数据库

    昨天我们介绍的融合基因查询的数据库,可以查询发生基因融合的基因。由于发生了基因融合,所以就相当于形成了新的基因,对...

  • STAR-Fusion带你深入了解融合基因

    1、融合基因介绍 融合基因(fusion gene),是指两个基因的部分序列发生融合形成的嵌合基因,一般由于染色体...

  • 融合基因标准品/质控品/参考品

    基因融合与肿瘤发生 融合基因(fusion gene),是指两个基因的部分序列发生融合形成的嵌合基因,一般由于染色...

  • 融合基因学习笔记

    概述 融合基因是指两个基因的全部或部分序列融合而成的嵌合基因,一般由染色体易位、缺失等原因所致。融合基因首次发现于...

  • 融合基因

    融合基因(Fusion Gene) 是指将两个或多个基因的编码区首尾相连.置于同一套调控序列(包括启动子、增...

  • 融合基因(Fusion)主要检测方法

    一、融合基因定义 融合基因:是指两个基因的全部或一部分的序列相互融合为一个新的基因的过程。其有可能是染色体易位、中...

  • 12个NPC病人转录组测序看基因融合事件

    通常,基因融合会产生基因融合转录本和嵌合蛋白产物,它们已被用作治疗的靶标。众所周知的例子是靶向BCR-ABL1基因...

  • 融合基因调控预测可视化网站

    写在前面 前两天我们介绍了两个和融合基因有关的数据库。其中涉及到融合基因的查找和功能预测。对于融合基因的功能的话方...

  • 使用FuGePrior来对转录组数据查找融合基因

    使用FuGePrior来对转录组数据查找融合基因 前面我们说到过,做融合基因分析的软件已经非常多了,但是2017年...

网友评论

      本文标题:20201118-融合基因

      本文链接:https://www.haomeiwen.com/subject/egkciktx.html