美文网首页
改名+压缩

改名+压缩

作者: rong酱 | 来源:发表于2020-09-17 20:38 被阅读0次
for i in `ls ./raw_data/*/*.fq.gz`
do
        sample_name=`echo $i | awk -F "/" '{print $NF}' | awk -F "." '{print $1}'`
        sample=`echo $i | awk -F "/" '{print $NF}'`
        cd ${path}
        mkdir ${sample_name} 
        cd ${sample_name}
        ln -s $i ./
        zcat ${sample} | split -16000000 
        count=0
        for z in `ls x*` 
        do
                count=$((${count}+1))
                /bin/mv ${z} ${sample_name}_00${count}.fastq
        done
done

创建目录
链接
解压分割
改名

相关文章

网友评论

      本文标题:改名+压缩

      本文链接:https://www.haomeiwen.com/subject/ffyryktx.html