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差异分析

差异分析

作者: byejya | 来源:发表于2021-05-21 15:12 被阅读0次

使用脚本:https://github.com/BioinfoUNIBA/QEdit

目录:

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参考流程:

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第一步:做ArteryTibial_vs_BrainCerebellum.sif文件

方法:利用sample_status_file_creator.py脚本

            看脚本,输入文件需要至少四列,第四列为SRR号,第一列为分组

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输出文件:

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看样子,可以省略这步自己做输出文件就行。

文件做出之后需要先挪redi结果,位置在../tables,是他程序写死的位置,不灵活。之后就是DE,这里报错不能有Un为chr。看来还需要先做小文件试一试。

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测试小的:

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删除62的Un

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63 65 66 都删了

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