【分子分型>>免疫】02.IMMPORT+亚型+Glioma(4

作者: 高大石头 | 来源:发表于2021-05-14 00:30 被阅读0次

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PMID: 33425739
杂志：Frontiers in Oncology

Dataset	Patient Size	Transcriptome Platform	Tissue
TCGA	703	RNA-seq	LGG+GBM
GSE16011	248		glioma

核心图

Fig.1

整体思路

摘要

作者从IMMPORT数据库提取免疫相关基因列表，并从TCGA数据库提取免疫相关基因表达，随后用一致性聚类将样本分为3类，用PCA、t-SNE证明分类的可靠性。并针对3个亚型进行免疫套餐分析。

结果

1.一致性聚类

Fig.1

2. 各个亚型的特异基因

Fig.2

3.免疫周边分析

3.1 stromal score,immune score和IDH突变

Fig.3

3.2 免疫细胞浸润

Fig.4

Fig.5

3.3 免疫检查点和TMB

Fig.6

3.4 体细胞突变瀑布图

Fig.7

3.5 独立预后分析

Fig.8

总结

亚型分开后，可进行相关检查，让结果和食疗更准确。

参考链接：
Three Immune-Associated Subtypes of Diffuse Glioma Differ in Immune Infiltration, Immune Checkpoint Molecules, and Prognosis

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