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结构变异名词整理

结构变异名词整理

作者: 你住拍了了 | 来源:发表于2021-09-19 07:46 被阅读0次

一些名词整理

结构变异(structure variation):基因组上发生大片段插入(insertion)、缺失(deletion)、易位(translouction)、倒位(inversion)重复(duplication)等类型的变异,大片段通常指大于30或50bp的区域。

染色体碎裂:一个染色体在复制过程中被打碎,然后这些碎片以另一种顺序重组;

拷贝数变异:通常指长度为1Kb以上的基因组大片段的拷贝数增加或减少,是结构变异重要组成部分;

重复序列变异:指1-6bp短串联重复序列STR(short tandem repeat)、微卫星不稳定性MSI(microsatellite instability)以及6bp以上可变串联重复序列(variable number of tandem repeats),比如AGTTA-AGTTA-AGTTA变为AGTTA-AGTTA。

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