一些名词整理
结构变异(structure variation):基因组上发生大片段插入(insertion)、缺失(deletion)、易位(translouction)、倒位(inversion)重复(duplication)等类型的变异,大片段通常指大于30或50bp的区域。
染色体碎裂:一个染色体在复制过程中被打碎,然后这些碎片以另一种顺序重组;
拷贝数变异:通常指长度为1Kb以上的基因组大片段的拷贝数增加或减少,是结构变异重要组成部分;
重复序列变异:指1-6bp短串联重复序列STR(short tandem repeat)、微卫星不稳定性MSI(microsatellite instability)以及6bp以上可变串联重复序列(variable number of tandem repeats),比如AGTTA-AGTTA-AGTTA变为AGTTA-AGTTA。
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