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TOOLS:Snakemake用于自动化任务投递,shell脚本

TOOLS:Snakemake用于自动化任务投递,shell脚本

作者: wo_monic | 来源:发表于2019-06-09 17:27 被阅读2次

据说,snakemake比shell脚本更适合于自动化任务的投放。目前我用的比较多的是shell脚本。对于公共服务器集群,需要按节点分配使用的。或许snakemake更适合。
snakemake官网
参考地址一
徐州更教程
snakemake是python编写的。解释:snake + make =snake make ,snake 源于python。蛇&蟒蛇。make和我们平时用的make编译命令一样。不过snakemake用的是python编译,make用的是C编译。
snakemake官方推荐安装mini conda3。
在没有root权限的服务器安装时候,需要特别设定。

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