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GephI美化蛋白互作网络

GephI美化蛋白互作网络

作者: 余绕 | 来源:发表于2023-03-30 15:25 被阅读0次

1.把蛋白IDs提交至String,并 互作获得蛋白互作信息。

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2. 准备GephI数据

1.互作数据

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其中Weight 是combined_score,Source和Target分别为Node1和Node2。

2. 属性数据

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其中Id是互作数据中Surce和Targe的所有Ids。

3. 导入数据

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注意互作数据导入的是边表格,分隔符注意一下,,
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导入数据之后,选择预览,然后点击布局,选择Fruchterman Reingold
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4.导入属性文件

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5. 设置分类

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上一步产生分类数据


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6.设置点的大小

1.手动输入固定值
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2. 根据属性文件设置
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7. 添加蛋白名称
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