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DISEASES | 周更的基因-疾病关联数据库

DISEASES | 周更的基因-疾病关联数据库

作者: fatlady | 来源:发表于2019-01-18 18:18 被阅读3次

写在前面

https://diseases.jensenlab.org/Search
DISEASES 每周更新,它集成了来自自动文本挖掘、手工整理的文献、癌症突变数据和全基因组关联研究的疾病基因关联证据。

可以根据基因(疾病)名称,查询到相关的疾病(基因)。并且有相应的文献链接。针对不同来源的数据,会给出一个统一的score值,5颗星星代表可信度最高,1颗星星则可信度最低。

简单操作

  • 在网站输入基因或疾病名称,比如ApoE
    ApoE
  • 点击第一个ApoE进去,可以看到该基因相关疾病、数据来源、分值。
    其中数据有三个来源,分别是Text mining (数据挖掘,需要进一步根据文献确认)、Knowledge(其他数据库)、Experiments(其他数据库)

    相关疾病
    相关疾病
  • 点击Text Mining中对应疾病名称,可以看到疾病介绍及相关文献。建议看下文章摘要确认是否真的有相关性,如果摘要中有相应的基因名会被自动标注出来。

    文献参考
  • 点击Knowledge和Experiments相应的疾病,会跳转到对应数据库。

  • 同理,输入疾病名称,如Alzheimer's disease,则会出现与该疾病相关的基因名称。数据来源也是三种。

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