IPF:GSE136831，这个数据跟我平时处理的单细胞数据格式不一样，查过问过请教过，原来是这里下载得到的是稀疏矩阵。
sparse matrix是用来存储大型稀疏矩阵用得，单细胞表达数据基本都用这个格式来存储，因为单细胞很大部分都是0，用普通文本矩阵存储太占空间。
使用简单：
library("Matrix")
readsCount <- read.csv("data/count.csv", header = T, row.names = 1)
readsCountSM <- as(as.matrix(readsCount), "dgCMatrix")
转回去，as.matrix() 就可以了
TIPs: 用R的dgCMatrix包来构建稀疏矩阵 | sparse matrix by dgCMatrix；下载数据包含“sparse”字样考虑是稀疏矩阵
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IPF:GSE136831，这个数据跟我平时处理的单细胞数据格式不一样，查过问过请教过，原来是这里下载得到的是稀疏...
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本文标题：单细胞-稀疏矩阵
本文链接：https://www.haomeiwen.com/subject/whajsrtx.html
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