conda更新

conda --version
conda update conda

conda create environment

create and install: conda create -n env_name package_name
activate: source activate env_name
deactivate: source deactivate
查看所有的environmrnts: conda info --envs. 已经激活的会带*号。
指定安装版本：conda create --n snakes python=3.5
查看某个环境下的安装包有哪些： source activate env_name; conda list
在某个环境下搜索某个安装包：source activate env_name;conda search package.name
在某个环境下安装包： source activate env_name; conda install package.name

conda configuration

我从官网上看，总体感觉就是如果配置的很好的话，会给自己减轻好多麻烦。
configuration特点：

1. .condarc这个文件并不是你装完conda就有了，需要用conda config自己去添加。
2. 可以放在家目录也可以放在root目录。并且root目录的.condarc会覆盖家目录的。
3. .condarc遵循YAML语法
4. .condarc大致可以配置一下特点
   4.1 conda应该去哪里下载包（包的源和库）
   首先一般建议先添加几个源
   conda config --add channels conda-forge
   conda config -ass channels bioconda
   conda config -add channels defaults
   conda config -add channels r
5. 阻止conda自己更新 conda config --set auto_update_conda False, 默认是T
6. 关于channels和default_channels, 我没看明白两者的区别。
   就是发现如果用conda config -add channels bioconda/https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/conda-forge/
   channels那一栏会发生变化，我模仿网上文件，修改了channels和default_channels.我的理解就是，channels里的defaults就是default_channels.

reference

conda
(https://www.jianshu.com/p/5e21a225ad83)
(https://www.jianshu.com/p/10cf7c059bf9)