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测序饱和度评估

测序饱和度评估

作者: Peng_001 | 来源:发表于2020-06-12 11:48 被阅读0次

测序饱和的意义

  • 测序深度和基因组覆盖率为正相关关系。


一般测序深度选择在10X。(人基因组为3G,但一般序列测序文件大小为30G,加上其他内容,一个人至少要100G)

测序不饱和的影响

  • 对DNA 序列来说,测序不饱和,影响拼接。
  • RNA-seq 定量不准。
  • 宏基因组不能准确反映物种组成。

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