药用塑料瓶设计方面为保证瓶口与瓶盖的配合和密封效果瓶口和螺纹部分设计的较厚以使其有足够强度，瓶身部分厚度则相应较薄，一般厚度控制在1.0-1.5mm，并有增厚的趋势，并力求各部厚度均匀，为适应高速自动灌装线的要求，瓶体应具有良好的稳定性，高径比不宜过大，一般不超过3:1，瓶底不宜过小，瓶底中部应设计成向上凸起。可以增加瓶的稳定性和底部抗内压强度，瓶口的尺寸也不应太小，除考虑药品尺寸和用药方便外，还应考虑灌装机装药的要求。
药用塑料瓶瓶口与瓶盖相互配合随着瓶口的外螺纹与瓶盖内螺纹的锁紧实现对瓶口的密封，若是平压式密封随着瓶盖的锁紧，瓶口平面与瓶盖内平面将密封垫片（如橡胶、纸板等）压合接触，从而达到密封的效果；侧壁式密封则是随着瓶盖的锁紧，瓶盖将被制成倒锥形或橄榄面形的内塞（可以是单独的，也可以与瓶盖一体的）压人瓶口内侧 ，靠内塞尺寸与瓶口内径的过盈配合实现密封,无论哪一种密封瓶盖的质量和与瓶口的配合是关键。
药用塑料瓶体外形尺寸误差应控制在规定范围内，平高尺寸误差控制在0.5mm范围内，瓶口直径误差控制在010mm范围内，瓶身尺寸误差应控制在0.5mm范围内，才能保证药剂灌装的顺利进行。
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