R语言行名有重复不能读入的解决方法（笔记）

作者: 麦子菇娘 | 来源:发表于2021-05-21 15:56 被阅读0次

R语言行名有重复不能读入的解决方法（笔记）
R读取Excel、R与本机文件
Renaming files
React之PureComponent
Permission denied解决
R读入大文件
DatistEQ之字母井名可逆向匹配方案设计
R语言打基础 — boxplot / heatmap
R
2020-05-08 复现GSE137675 RNA-Seq结果

读入数据的时候遇到行名有重复而报错的情况，如下图

mydata<-read.table("data_RNA_Seq_v2_mRNA_median_ Zscores.txt", header = T, row.names=1, check.names = F)

报错：Error in read.table("data_RNA_Seq_v2_mRNA_median _Zscores.txt", header = T, : 'row.names'里不能有重复的名字

此时可以使用base包中的make.names()函数

使用方法：

1.先不设置行名将数据读进去

mydata<-read.table("data_RNA_Seq_v2_mRNA_median_ Zscores.txt", header = T, check.names = F)

2.使用make.names函数将第一列作为行名

row.names(mydata<-make.names(mydata[,1],TRUE)

关于make.names函数的使用方法可以通过？make.names获得

3. 删除第一列

mydata<-mydata[,-1]

4.查看数据前五行前五列看是否行名修改完成

mydata[1:5,1:5]

R语言行名有重复不能读入的解决方法（笔记）
读入数据的时候遇到行名有重复而报错的情况，如下图 mydata<-read.table("data_RNA_Seq...
R读取Excel、R与本机文件
R读取Excel、R与本机文件以下内容是我在R语言学习过程中的每一课的重点笔记记录。 16R语言读入本机文件 1...
Renaming files
普通模式下输入:h rename-files :r !ls *.c 将文件名读入缓冲区 :%s/(.).c/mv ...
React之PureComponent
本篇目录 React避免重复渲染举例 PureComponent原理问题解决方法immutable.js 总结 R...
Permission denied解决
缺少权限导致解决方法： sudo chmod -R 777 目录名 -R 指定目录里的所有子目录和文件777 设...
R读入大文件
在建立好了模型后，需要倒入实际运用数据来操作。把很大，甚至几个G的文件导入到R是一个问题。尝试使用read.tab...
DatistEQ之字母井名可逆向匹配方案设计
一、R系统字母井名现状基本规则，以井名拼音作为字母井名，对于转换后重复的井名加字母区分。（字母为大写）R系统中共有...
R语言打基础 — boxplot / heatmap
这是我听B站—鲮鱼不会飞视频（R语言相关内容补充）里的笔记哦~ 先读入我们的数据参数解读：使用read.tab...
R
q1：r中读入csv文件时，读入所有的列合并为一列 A1：此时因为保存时是write.table()，，所以读入直...
2020-05-08 复现GSE137675 RNA-Seq结果
将上游分析最后得到的counts.txt读入到R中读入作者上传的表达矩阵GSE137675_Reads_coun...